Tepatlaxco conserva relictos de bosque mesófilo de montaña, uno de los
ecosistemas más diversos y amenazados de México. La información oficial
del municipio documenta además arroyos tributarios del río Jamapa y
numerosas cuevas, varias de ellas sin exploración completa.

El clima templado-húmedo favorece encinos, fresnos, sauces y vegetación
asociada con barrancas. La combinación de roca, agua y humedad origina
cavidades y escurrimientos subterráneos.

Las cuevas no deben explorarse sin guía y equipo. El bosque mesófilo es
especialmente sensible a tala, incendios y cambio de uso de suelo, por
lo que la visita debe minimizar el impacto y evitar extracción de
plantas.