El Templo de San José se encuentra en uno de los sectores históricos de Xalapa y forma parte de la Zona de Monumentos Históricos reconocida por el Instituto Nacional de Antropología e Historia. El INAH incluye expresamente a San José entre los edificios destinados al culto religioso que poseen valor histórico y arquitectónico dentro del polígono protegido de la ciudad.

La historia del barrio ayuda a comprender la importancia del templo. El INAH señala que el asentamiento prehispánico de Xalapa estuvo integrado por los barrios de Xallapan, Xallitic y Techacapan; posteriormente se incorporó Tlalmecapan. Techacapan corresponde al sector histórico asociado con el actual barrio de San José. Después de la llegada de los españoles, Xalapa se reorganizó sobre el mismo espacio general del asentamiento anterior y durante el siglo XVI adquirió importancia por su posición en la ruta comercial entre Veracruz y México.

San José quedó integrado al desarrollo urbano de una ciudad que durante los siglos virreinales creció alrededor de caminos, barrios, manantiales y espacios religiosos. El INAH delimita actualmente una Zona de Monumentos Históricos de aproximadamente 0.33 kilómetros cuadrados y 28 manzanas, con construcciones de los siglos XVII al XIX. Dentro de ese conjunto aparecen la Catedral de Santa María, el Beaterio, el Templo de San José y el antiguo Palacio Episcopal, además de edificios civiles y espacios públicos.

Actualmente San José continúa siendo un referente del barrio del mismo nombre y puede incorporarse a un recorrido por la zona histórica de Xalapa. Su interés no se limita al edificio religioso: permite reconocer la continuidad de uno de los sectores más antiguos de la ciudad y su relación con el crecimiento de Xalapa desde los barrios originarios hasta la ciudad novohispana y posteriormente la capital del estado.